تتنوع أسباب أمراض الكلى، ومن أهمها:
ارتفاع ضغط الدم: يعتبر السبب الرئيسي لمرض الكلى المزمن.
داء السكري: يضر الأوعية الدموية في الكلى ويؤدي إلى تلفها.
التهاب الحلق والجلد: قد تسبب بعض أنواع البكتيريا التي تسبب التهاب الحلق والجلد التهاب الكلى.
الأدوية: بعض الأدوية قد تسبب تلفًا في الكلى.
العوامل الوراثية: بعض أمراض الكلى تكون وراثية.